Lernziele und Kompetenzen: Die Studierenden lernen grundlegende Methoden der Bioinformatik kennen. Nach dem erfolgreichen Teilnahme an diesem Modul verfügen sie über Grundkenntnisse in den Bereichen Dynamisches Programmieren, Sequenzalignment, Rekonstruktion phylogenetischer Bäume und haben einen Einblick in grundlegende Ansätze der bioinformatischen Analyse von Molekülstrukturen. Im praktischen Teil des Moduls erwerben die Studierenden Grundkenntnisse des Betriebssystems LINUX bzw. UNIX und der Programmiersprache PERL bzw. einer vergleichbaren Sprache. Sie sind in der Lage, einfache Programme zu entwerfen und zu implementieren, um grundlegende Aufgaben der Datenverarbeitung selbständig in einer UNIX/LINUX-Umgebung zu lösen.

Prüfungsanforderungen: Grundlegende Methoden und Algorithmen der Bioinformatik: Paarweises und multiples Sequenzalignment, Hidden-Markov-Modelle, Grundlegende Algorithmen zur Rekonstruktion phylogenetischer Bäume, Algorithmen zur Analyse von Molekülstrukturen, Datenbanken, Analyse regulatorischer und metabolischer Netzwerke, Bioinformatik der Genregulation. Grundlegende Kenntnisse des Betriebssystems LINUX bzw. UNIX, grundlegende Programmierkenntnisse in PERL oder vergleichbaren Sprachen.


Lehrveranstaltungen und Prüfungen
1. Praktikum: Linux und Perl für Biologen (3 SWS) [B.Bio.114-1]
2. Vorlesung: Grundlagen der Bioinformatik mit Übung (4 SWS) [B.Bio.114-2]

Modulprüfung B.Bio.114-1: Klausur (120 Minuten), unbenotet
Modulprüfung B.Bio.114-2: mündliche Prüfung (ca. 30 Minuten), unbenotet


Art des Moduls
Wahlpflichtmodul

Zugangsvoraussetzungen
mindestens 40 C aus dem ersten Studienabschnitt;
B.Bio.114-1 ist Voraussetzung für B.Bio.114-2

Empfohlene Vorkenntnisse
B.Bio.113 "Angewandte Bioinformatik I"

Wiederholbarkeit
zweimalig

Angebotshäufigkeit
B.Bio.114-1: in jeden Semesterferien
B.Bio.114-2: jedes Sommersemester

Empfohlenes Fachsemester
3 - 6

Dauer
Das Modul kann in einem Semester abgeschlossen werden.

Sprache
deutsch

Maximale Studierendenzahl
25

Modulkoordinator/in
Prof. Dr. Burkhard Morgenstern