Biodiversitäts-Exploratorien - Beechadapt

Genetische und adaptive Variation der Buche (Fagus sylvatica): Welche Faktoren beeinflussen ihre räumlichen Verteilungsmuster?

Ziele:


  • Identifizierung von vermutlich anpassungsrelevanten Genen

  • Analyse der genetischen Diversität in diesen „Kandidatengenen“ für die anpassungsrelevanten Merkmale Trockenheitsresistenz und Austrieb, da die Exploratorien entlang eines Niederschlags- und Temperaturgradienten liegen

  • Untersuchung der Angepasstheit von Buchensämlingen in reziproken Translokationsexperimenten, zur späteren Assoziation von genetischer Variation mit phänotypischen Merkmalen (mögliches Folgeprojekt)


Hypothesen:

  • Wir erwarten eine höhere Differenzierung an adaptiven Genen im Vergleich zu „neutraler“ genetischer Variation.

  • Wir erwarten eine bessere Angepasstheit lokaler Sämlinge im Vergleich zu Nachkommen aus anderen Exploratorien.

  • Außerdem wird der Einfluss unterschiedlich intensiver Waldbewirtschaftung auf möglicherweise anpassungsrelevante Variation in Kandidatengenen untersucht.


Methoden:

  • Transkriptomanalysen mittels Hochdurchsatzsequenzierung sowie die Verwendung von Kandidatengene aus vorangegangener Untersuchungen bei Buche und Eichen (Quercus spp.)

  • Analyse ausgewählter SNPs (Single Nucleotide Polymorphisms) innerhalb der Kandidatengene

  • Aufnahme phänotypischer Daten wie z.B. Überleben, Austriebsverhalten und Höhenzuwachs



Kontakt: Markus Müller, Reiner Finkeldey

Laufzeit: 2011 - 2017

Fördernde Institution: Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG)

Veröffentlichungen:

  • Müller M, Seifert S, Lübbe T, Leuschner C, Finkeldey R (2017) De novo transcriptome assembly and analysis of differential gene expression in response to drought in European beech. PLOS ONE 12: e0184167. doi: 10.1371/journal.pone.0184167

  • Müller M, Seifert S, Finkeldey R (2017) Comparison and confirmation of SNP-bud burst associations in European beech populations in Germany. Tree Genetics and Genomes 13: 59. doi: 10.1007/s11295-017-1145-9

  • Müller M*, Seifert* S, Finkeldey R (2015) Identification of SNPs in candidate genes potentially involved in bud burst in European beech (Fagus sylvatica L.). Silvae Genetica 64: 1-20. *equal contribution



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